Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNI2Q6ZMN8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms