Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSMFQ6X4W1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSMFQ6X4W1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms