Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXY8

TMC5, Transmembrane channel-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC5Q6UXY8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMC5Q6UXY8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC5Q6UXY8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMC5Q6UXY8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC5Q6UXY8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC5Q6UXY8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC5Q6UXY8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC5Q6UXY8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC5Q6UXY8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC5Q6UXY8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC5Q6UXY8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC5Q6UXY8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC5Q6UXY8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC5Q6UXY8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC5Q6UXY8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC5Q6UXY8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC5Q6UXY8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC5Q6UXY8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms