Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC171Q6TFL3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms