Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LARP1Q6PKG0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LARP1Q6PKG0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms