Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIU1

KCNV1, Potassium voltage-gated channel subfamily V member 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNV1Q6PIU1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNV1Q6PIU1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms