Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIS1

SLC23A3, Solute carrier family 23 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC23A3Q6PIS1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC23A3Q6PIS1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC23A3Q6PIS1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms