Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC27A1Q6PCB7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A1Q6PCB7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC27A1Q6PCB7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms