Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRPF40BQ6NWY9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRPF40BQ6NWY9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms