Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
APOBEC3HQ6NTF7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBEC3HQ6NTF7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms