Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCSAPQ6IQ19 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCSAPQ6IQ19 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCSAPQ6IQ19 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCSAPQ6IQ19 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCSAPQ6IQ19 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCSAPQ6IQ19 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCSAPQ6IQ19 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCSAPQ6IQ19 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCSAPQ6IQ19 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCSAPQ6IQ19 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCSAPQ6IQ19 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCSAPQ6IQ19 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCSAPQ6IQ19 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCSAPQ6IQ19 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCSAPQ6IQ19 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCSAPQ6IQ19 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCSAPQ6IQ19 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
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