Protein–RNA interactions for Protein: Q68DH5

LMBRD2, LMBR1 domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD2Q68DH5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LMBRD2Q68DH5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBRD2Q68DH5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms