Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WSCD1Q658N2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms