Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SHEQ5VZ18 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms