Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRCH2Q5VUJ6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms