Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf135Q5VTT2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms