Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC18Q5T9S5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC18Q5T9S5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC18Q5T9S5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC18Q5T9S5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC18Q5T9S5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC18Q5T9S5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC18Q5T9S5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC18Q5T9S5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC18Q5T9S5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC18Q5T9S5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC18Q5T9S5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC18Q5T9S5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC18Q5T9S5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC18Q5T9S5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC18Q5T9S5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC18Q5T9S5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC18Q5T9S5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC18Q5T9S5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC18Q5T9S5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC18Q5T9S5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC18Q5T9S5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC18Q5T9S5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC18Q5T9S5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC18Q5T9S5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC18Q5T9S5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC18Q5T9S5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC18Q5T9S5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC18Q5T9S5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC18Q5T9S5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC18Q5T9S5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCDC18Q5T9S5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCDC18Q5T9S5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCDC18Q5T9S5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCDC18Q5T9S5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCDC18Q5T9S5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCDC18Q5T9S5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCDC18Q5T9S5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC18Q5T9S5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC18Q5T9S5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms