Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM78Q5T7P6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM78Q5T7P6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms