Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D2

TREML2, Trem-like transcript 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML2Q5T2D2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TREML2Q5T2D2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TREML2Q5T2D2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms