Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CEP170Q5SW79 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC35.51■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CEP170Q5SW79 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CEP170Q5SW79 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CEP170Q5SW79 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
CEP170Q5SW79 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CEP170Q5SW79 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CEP170Q5SW79 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CEP170Q5SW79 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CEP170Q5SW79 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
CEP170Q5SW79 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
CEP170Q5SW79 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CEP170Q5SW79 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CEP170Q5SW79 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CEP170Q5SW79 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
CEP170Q5SW79 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CEP170Q5SW79 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CEP170Q5SW79 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms