Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHYHD1Q5SRE7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHYHD1Q5SRE7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms