Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC27A3Q5K4L6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms