Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMPD3Q5JV73 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMPD3Q5JV73 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms