Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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