Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms