Protein–RNA interactions for Protein: Q56UQ5

TPT1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q56UQ5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q56UQ5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q56UQ5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q56UQ5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q56UQ5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q56UQ5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q56UQ5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q56UQ5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q56UQ5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q56UQ5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q56UQ5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q56UQ5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q56UQ5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q56UQ5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q56UQ5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q56UQ5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q56UQ5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q56UQ5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q56UQ5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q56UQ5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q56UQ5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q56UQ5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q56UQ5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q56UQ5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q56UQ5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q56UQ5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q56UQ5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q56UQ5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q56UQ5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q56UQ5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q56UQ5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q56UQ5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q56UQ5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q56UQ5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q56UQ5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q56UQ5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q56UQ5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q56UQ5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q56UQ5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q56UQ5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q56UQ5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q56UQ5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q56UQ5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q56UQ5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q56UQ5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q56UQ5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q56UQ5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q56UQ5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q56UQ5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q56UQ5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q56UQ5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q56UQ5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q56UQ5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q56UQ5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q56UQ5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q56UQ5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q56UQ5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q56UQ5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q56UQ5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q56UQ5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q56UQ5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q56UQ5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q56UQ5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q56UQ5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q56UQ5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q56UQ5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q56UQ5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q56UQ5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q56UQ5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q56UQ5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q56UQ5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q56UQ5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q56UQ5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q56UQ5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q56UQ5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q56UQ5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Q56UQ5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Q56UQ5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Q56UQ5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q56UQ5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q56UQ5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q56UQ5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q56UQ5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q56UQ5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q56UQ5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q56UQ5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q56UQ5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q56UQ5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q56UQ5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q56UQ5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q56UQ5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q56UQ5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q56UQ5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q56UQ5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Q56UQ5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q56UQ5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q56UQ5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q56UQ5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q56UQ5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q56UQ5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms