Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGO2Q562F6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGO2Q562F6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGO2Q562F6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms