Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP13A4Q4VNC1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP13A4Q4VNC1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms