Protein–RNA interactions for Protein: Q4G163

FBXO43, F-box only protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO43Q4G163 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO43Q4G163 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO43Q4G163 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms