Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LINC00303Q3SY05 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00303Q3SY05 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms