Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TWISTNBQ3B726 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TWISTNBQ3B726 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms