Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms