Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NDUFA9Q16795 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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NDUFA9Q16795 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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NDUFA9Q16795 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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NDUFA9Q16795 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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NDUFA9Q16795 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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