Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
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FOXD1Q16676 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
FOXD1Q16676 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
FOXD1Q16676 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
FOXD1Q16676 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
FOXD1Q16676 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
FOXD1Q16676 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
FOXD1Q16676 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
FOXD1Q16676 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
FOXD1Q16676 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
FOXD1Q16676 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
FOXD1Q16676 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
FOXD1Q16676 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
FOXD1Q16676 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC32■■■□□ 2.71
FOXD1Q16676 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
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FOXD1Q16676 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
FOXD1Q16676 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
FOXD1Q16676 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
FOXD1Q16676 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
FOXD1Q16676 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
FOXD1Q16676 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
FOXD1Q16676 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
FOXD1Q16676 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
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FOXD1Q16676 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
FOXD1Q16676 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
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FOXD1Q16676 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
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FOXD1Q16676 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
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FOXD1Q16676 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
FOXD1Q16676 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
FOXD1Q16676 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
FOXD1Q16676 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
FOXD1Q16676 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
FOXD1Q16676 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
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FOXD1Q16676 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
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FOXD1Q16676 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
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FOXD1Q16676 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC31.97■■■□□ 2.71
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FOXD1Q16676 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
FOXD1Q16676 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
FOXD1Q16676 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
FOXD1Q16676 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
FOXD1Q16676 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
FOXD1Q16676 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
FOXD1Q16676 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
FOXD1Q16676 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
FOXD1Q16676 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
FOXD1Q16676 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
FOXD1Q16676 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
FOXD1Q16676 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
FOXD1Q16676 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC31.94■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
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