Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABRA6Q16445 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABRA6Q16445 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms