Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A5Q15758 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A5Q15758 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A5Q15758 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A5Q15758 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A5Q15758 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A5Q15758 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A5Q15758 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A5Q15758 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A5Q15758 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A5Q15758 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A5Q15758 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A5Q15758 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A5Q15758 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A5Q15758 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A5Q15758 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A5Q15758 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A5Q15758 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A5Q15758 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A5Q15758 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A5Q15758 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A5Q15758 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A5Q15758 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A5Q15758 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A5Q15758 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A5Q15758 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A5Q15758 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A5Q15758 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A5Q15758 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A5Q15758 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A5Q15758 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A5Q15758 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A5Q15758 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms