Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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