Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKD1Q15139 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
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