Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LAPTM4AQ15012 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAPTM4AQ15012 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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