Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SHPRHQ149N8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
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