Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 NDUFB2-211ENST00000476181 660 ntTSL 1 (best)18.74■□□□□ 0.592e-8■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.572e-8■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 NDUFB2-205ENST00000464564 469 ntTSL 518.57■□□□□ 0.562e-8■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.452e-8■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.432e-8■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.372e-8■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.22e-8■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.12e-8■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 RBM8A-203ENST00000498663 764 ntTSL 213.31□□□□□ -0.282e-8■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 RBM8A-202ENST00000484825 542 ntTSL 513.31□□□□□ -0.282e-8■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 RBM8A-209ENST00000634161 464 ntTSL 312.84□□□□□ -0.352e-8■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 NDUFB2-206ENST00000464566 726 ntTSL 311.95□□□□□ -0.52e-8■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 RBM8A-204ENST00000583313 4961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.512e-8■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 COX6C-202ENST00000517682 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.992e-8■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.012e-8■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 COX6C-201ENST00000297564 433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.062e-8■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 COX6C-203ENST00000518171 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.062e-8■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 COX6C-207ENST00000522934 562 ntTSL 48.28□□□□□ -1.082e-8■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.172e-8■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 NDUFB2-210ENST00000475276 539 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.182e-8■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 COX6C-206ENST00000520517 566 ntTSL 47.51□□□□□ -1.212e-8■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 NDUFB2-214ENST00000479181 665 ntTSL 26.99□□□□□ -1.292e-8■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 NDUFB2-215ENST00000482954 544 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.342e-8■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.372e-8■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.52e-8■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.672e-8■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 SCAF11-202ENST00000369367 7543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.898e-9■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 BCOR-202ENST00000378444 6358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.583e-6■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 BCOR-205ENST00000397354 6258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.793e-6■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 SLTM-213ENST00000557950 924 ntTSL 38.09□□□□□ -1.113e-7■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 HSP90B1-207ENST00000550595 694 ntTSL 25.92□□□□□ -1.467e-23■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.443e-6■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.453e-6■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 GRIPAP1-212ENST00000619149 2828 ntTSL 211.45□□□□□ -0.583e-6■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 GRIPAP1-201ENST00000376423 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.593e-6■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 GRIPAP1-202ENST00000473581 3278 ntTSL 210.9□□□□□ -0.663e-6■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 GRIPAP1-209ENST00000611757 3255 ntTSL 29.38□□□□□ -0.913e-6■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 EZR-204ENST00000476189 956 ntTSL 313.37□□□□□ -0.272e-6■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 MRPS5-207ENST00000482568 711 ntTSL 313.25□□□□□ -0.291e-6■■□□□ 14
PUM1Q14671 HNRNPUL1-210ENST00000595806 1659 ntTSL 218.97■□□□□ 0.633e-15■■□□□ 14
PUM1Q14671 ATP2A2-203ENST00000377685 5702 ntTSL 521.2■□□□□ 0.983e-6■■□□□ 14
PUM1Q14671 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.363e-6■■□□□ 14
PUM1Q14671 GTF3C6-202ENST00000480191 800 ntTSL 35.46□□□□□ -1.541e-6■■□□□ 14
PUM1Q14671 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.942e-6■■□□□ 14
PUM1Q14671 PSMA7-202ENST00000370861 773 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.291e-11■■□□□ 14
PUM1Q14671 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.059e-7■■□□□ 14
PUM1Q14671 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.391e-7■■□□□ 14
PUM1Q14671 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.111e-7■■□□□ 14
PUM1Q14671 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.051e-7■■□□□ 14
PUM1Q14671 NUCB1-204ENST00000424608 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 520.28■□□□□ 0.842e-7■■□□□ 14
PUM1Q14671 NUCB1-207ENST00000452087 864 ntTSL 319.51■□□□□ 0.712e-7■■□□□ 14
PUM1Q14671 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.414e-7■■□□□ 14
PUM1Q14671 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.424e-7■■□□□ 14
PUM1Q14671 HDLBP-203ENST00000391975 6372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.614e-7■■□□□ 14
PUM1Q14671 HDLBP-201ENST00000310931 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.974e-7■■□□□ 14
PUM1Q14671 MRPS5-204ENST00000464458 648 ntTSL 312.91□□□□□ -0.341e-7■■□□□ 14
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PUM1Q14671 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.482e-6■■□□□ 14
PUM1Q14671 ARHGDIA-213ENST00000583499 560 ntTSL 224.11■■□□□ 1.452e-6■■□□□ 14
PUM1Q14671 ARHGDIA-211ENST00000582984 823 ntTSL 323.36■■□□□ 1.332e-6■■□□□ 14
PUM1Q14671 EP400NL-203ENST00000392352 2172 ntTSL 223.24■■□□□ 1.311e-8■■□□□ 14
PUM1Q14671 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.252e-6■■□□□ 14
PUM1Q14671 EP400NL-207ENST00000454179 781 ntTSL 221.3■■□□□ 11e-8■■□□□ 14
PUM1Q14671 AP2M1-211ENST00000460862 551 ntTSL 421.3■■□□□ 11e-8■■□□□ 14
PUM1Q14671 EP400NL-205ENST00000443539 1756 ntTSL 221.23■□□□□ 0.991e-8■■□□□ 14
PUM1Q14671 AP2M1-214ENST00000466598 684 ntTSL 221.18■□□□□ 0.981e-8■■□□□ 14
PUM1Q14671 AP2M1-204ENST00000427072 557 ntTSL 421.18■□□□□ 0.981e-8■■□□□ 14
PUM1Q14671 EP400NL-202ENST00000389560 1726 ntTSL 1 (best)20.51■□□□□ 0.871e-8■■□□□ 14
PUM1Q14671 EP400NL-210ENST00000537558 861 ntTSL 420.42■□□□□ 0.861e-8■■□□□ 14
PUM1Q14671 ARHGDIA-212ENST00000583111 574 ntTSL 220.23■□□□□ 0.832e-6■■□□□ 14
PUM1Q14671 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.81e-8■■□□□ 14
PUM1Q14671 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.792e-6■■□□□ 14
PUM1Q14671 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.762e-6■■□□□ 14
PUM1Q14671 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.652e-6■■□□□ 14
PUM1Q14671 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.651e-8■■□□□ 14
PUM1Q14671 AP2M1-220ENST00000487958 796 ntTSL 218.92■□□□□ 0.621e-8■■□□□ 14
PUM1Q14671 AP2M1-219ENST00000484469 558 ntTSL 318.5■□□□□ 0.551e-8■■□□□ 14
PUM1Q14671 PPP2R5E-203ENST00000553266 1690 ntTSL 1 (best)18.42■□□□□ 0.541e-8■■□□□ 14
PUM1Q14671 CDCA5-205ENST00000524733 835 ntTSL 318.39■□□□□ 0.531e-8■■□□□ 14
PUM1Q14671 EP400NL-209ENST00000488030 1366 ntTSL 218.26■□□□□ 0.511e-8■■□□□ 14
PUM1Q14671 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.482e-6■■□□□ 14
PUM1Q14671 ARHGDIA-206ENST00000580033 547 ntTSL 418.07■□□□□ 0.482e-6■■□□□ 14
PUM1Q14671 EP400NL-212ENST00000539351 564 ntTSL 417.72■□□□□ 0.431e-8■■□□□ 14
PUM1Q14671 CDCA5-208ENST00000529290 789 ntTSL 517.62■□□□□ 0.411e-8■■□□□ 14
PUM1Q14671 ARHGDIA-209ENST00000582309 628 ntTSL 217.36■□□□□ 0.372e-6■■□□□ 14
PUM1Q14671 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.375e-6■■□□□ 14
PUM1Q14671 ARHGDIA-205ENST00000579121 637 ntTSL 316.55■□□□□ 0.242e-6■■□□□ 14
PUM1Q14671 AP2M1-209ENST00000448139 601 ntTSL 515.53■□□□□ 0.081e-8■■□□□ 14
PUM1Q14671 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.071e-8■■□□□ 14
PUM1Q14671 AP2M1-210ENST00000455925 545 ntTSL 414.92□□□□□ -0.021e-8■■□□□ 14
PUM1Q14671 ARHGDIA-215ENST00000583868 815 ntTSL 314.62□□□□□ -0.072e-6■■□□□ 14
PUM1Q14671 EP400NL-213ENST00000613241 455 ntTSL 314.01□□□□□ -0.171e-8■■□□□ 14
PUM1Q14671 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.261e-8■■□□□ 14
PUM1Q14671 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.281e-8■■□□□ 14
PUM1Q14671 PPP2R5E-207ENST00000556878 3371 ntTSL 1 (best)12.21□□□□□ -0.451e-8■■□□□ 14
PUM1Q14671 CDCA5-210ENST00000533015 563 ntTSL 212.12□□□□□ -0.471e-8■■□□□ 14
PUM1Q14671 ARHGDIA-204ENST00000578351 421 ntTSL 411.87□□□□□ -0.512e-6■■□□□ 14
PUM1Q14671 CDCA5-206ENST00000525464 672 ntTSL 510.58□□□□□ -0.721e-8■■□□□ 14
PUM1Q14671 CAPRIN2-219ENST00000620681 926 ntTSL 26.39□□□□□ -1.391e-8■■□□□ 14
PUM1Q14671 RBM28-202ENST00000415472 2251 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.633e-6■■□□□ 14
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