Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEDD9Q14511 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
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