Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1CQ13936 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1CQ13936 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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