Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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TUBA3CQ13748 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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