Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
FHL3Q13643 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FHL3Q13643 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FHL3Q13643 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FHL3Q13643 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FHL3Q13643 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FHL3Q13643 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FHL3Q13643 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FHL3Q13643 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FHL3Q13643 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FHL3Q13643 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FHL3Q13643 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FHL3Q13643 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms