Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
NEUROD1Q13562 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
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