Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF4BQ13523 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF4BQ13523 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
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