Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBB3Q13509 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
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TUBB3Q13509 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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TUBB3Q13509 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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TUBB3Q13509 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
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