Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PDE3BQ13370 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDE3BQ13370 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
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