Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 RELA-205ENST00000525693 3183 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.474e-8■■■■■ 29.3
PABPC4Q13310 RELA-217ENST00000531484 2251 ntTSL 211.34□□□□□ -0.594e-8■■■■■ 29.3
PABPC4Q13310 ITM2A-201ENST00000373298 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.645e-12■■■■■ 29.3
PABPC4Q13310 ITM2A-202ENST00000434584 1698 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.795e-12■■■■■ 29.3
PABPC4Q13310 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.811e-7■■■■■ 29.2
PABPC4Q13310 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.561e-7■■■■■ 29.2
PABPC4Q13310 FPGS-208ENST00000467826 829 ntTSL 523.74■■□□□ 1.391e-7■■■■■ 29.2
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PABPC4Q13310 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.941e-7■■■■■ 29.2
PABPC4Q13310 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.81e-7■■■■■ 29.2
PABPC4Q13310 PHACTR4-202ENST00000373839 6190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.423e-6■■■■■ 29.2
PABPC4Q13310 PHACTR4-207ENST00000632964 1853 ntTSL 26.36□□□□□ -1.393e-6■■■■■ 29.2
PABPC4Q13310 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.264e-6■■■■■ 29.2
PABPC4Q13310 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.834e-6■■■■■ 29.2
PABPC4Q13310 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.614e-6■■■■■ 29.2
PABPC4Q13310 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.064e-6■■■■■ 29.2
PABPC4Q13310 SPECC1L-204ENST00000437398 6674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.434e-6■■■■■ 29.2
PABPC4Q13310 SPECC1L-201ENST00000314328 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.454e-6■■■■■ 29.2
PABPC4Q13310 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.533e-63■■■■■ 29.2
PABPC4Q13310 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.451e-6■■■■■ 29.1
PABPC4Q13310 MLST8-226ENST00000566835 1565 ntTSL 230.04■■■□□ 2.41e-6■■■■■ 29.1
PABPC4Q13310 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.091e-6■■■■■ 29.1
PABPC4Q13310 MLST8-230ENST00000568194 2116 ntTSL 1 (best)26.27■■□□□ 1.81e-6■■■■■ 29.1
PABPC4Q13310 MLST8-208ENST00000562392 1662 ntTSL 225.22■■□□□ 1.631e-6■■■■■ 29.1
PABPC4Q13310 MLST8-212ENST00000563067 1646 ntTSL 523.39■■□□□ 1.331e-6■■■■■ 29.1
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PABPC4Q13310 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.151e-6■■■■■ 29.1
PABPC4Q13310 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.991e-6■■■■■ 29.1
PABPC4Q13310 MLST8-231ENST00000568542 1865 ntTSL 1 (best)19.26■□□□□ 0.671e-6■■■■■ 29.1
PABPC4Q13310 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 29.1
PABPC4Q13310 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.012e-9■■■■■ 29.1
PABPC4Q13310 PTPN23-206ENST00000602307 5119 ntTSL 213.29□□□□□ -0.282e-9■■■■■ 29.1
PABPC4Q13310 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.343e-6■■■■■ 29.1
PABPC4Q13310 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.343e-6■■■■■ 29.1
PABPC4Q13310 MRPL23-206ENST00000429295 805 ntTSL 526.51■■□□□ 1.833e-6■■■■■ 29.1
PABPC4Q13310 MRPL23-207ENST00000462288 659 ntTSL 326.43■■□□□ 1.823e-6■■■■■ 29.1
PABPC4Q13310 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.863e-6■■■■■ 29.1
PABPC4Q13310 AC026954.2-201ENST00000315601 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 220.11■□□□□ 0.811e-6■■■■■ 29.1
PABPC4Q13310 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.691e-6■■■■■ 29.1
PABPC4Q13310 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.43e-6■■■■■ 29.1
PABPC4Q13310 XAB2-202ENST00000595288 4555 ntTSL 216.18■□□□□ 0.183e-18■■■■■ 29.1
PABPC4Q13310 MRPL23-203ENST00000397294 551 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 29.1
PABPC4Q13310 XAB2-201ENST00000358368 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.153e-18■■■■■ 29.1
PABPC4Q13310 RPL4-216ENST00000569438 565 ntTSL 517.5■□□□□ 0.394e-53■■■■■ 29.1
PABPC4Q13310 RPL4-212ENST00000566622 817 ntTSL 216.64■□□□□ 0.254e-53■■■■■ 29.1
PABPC4Q13310 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.51e-12■■■■■ 29.1
PABPC4Q13310 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.481e-12■■■■■ 29.1
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PABPC4Q13310 BAIAP2-225ENST00000576225 2316 ntTSL 220.2■□□□□ 0.821e-8■■■■■ 29
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PABPC4Q13310 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.581e-8■■■■■ 29
PABPC4Q13310 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.481e-8■■■■■ 29
PABPC4Q13310 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.071e-8■■■■■ 29
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PABPC4Q13310 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.772e-9■■■■■ 29
PABPC4Q13310 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.772e-9■■■■■ 29
PABPC4Q13310 STOML2-204ENST00000488050 904 ntTSL 512.15□□□□□ -0.462e-9■■■■■ 29
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PABPC4Q13310 ZCCHC9-201ENST00000254037 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.341e-17■■■■■ 29
PABPC4Q13310 ZCCHC9-202ENST00000380199 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.391e-17■■■■■ 29
PABPC4Q13310 APRT-203ENST00000562464 515 ntTSL 323.23■■□□□ 1.313e-15■■■■■ 29
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PABPC4Q13310 ZMYND8-201ENST00000262975 4139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.95e-8■■■■■ 29
PABPC4Q13310 FAM239B-202ENST00000424415 2194 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.576e-8■■■■■ 29
PABPC4Q13310 COQ8B-205ENST00000593724 2255 ntTSL 218.64■□□□□ 0.578e-8■■■■■ 28.9
PABPC4Q13310 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.518e-8■■■■■ 28.9
PABPC4Q13310 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.458e-8■■■■■ 28.9
PABPC4Q13310 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.651e-323■■■■■ 28.9
PABPC4Q13310 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.611e-323■■■■■ 28.9
PABPC4Q13310 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.431e-323■■■■■ 28.9
PABPC4Q13310 TCP1-215ENST00000544255 1403 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.061e-323■■■■■ 28.9
PABPC4Q13310 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.278e-22■■■■■ 28.9
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PABPC4Q13310 NDUFB6-201ENST00000350021 666 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.448e-22■■■■■ 28.9
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PABPC4Q13310 SPCS3-202ENST00000507001 478 ntTSL 26.97□□□□□ -1.291e-22■■■■■ 28.9
PABPC4Q13310 MRPL22-207ENST00000523037 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.191e-13■■■■■ 28.9
PABPC4Q13310 MRPL22-202ENST00000439747 784 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.821e-13■■■■■ 28.9
PABPC4Q13310 MRPL22-206ENST00000522038 3162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.911e-13■■■■■ 28.9
PABPC4Q13310 MRPL22-201ENST00000265229 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.931e-13■■■■■ 28.9
PABPC4Q13310 MRPL22-203ENST00000518364 481 ntTSL 27.88□□□□□ -1.151e-13■■■■■ 28.9
PABPC4Q13310 MRPL22-205ENST00000520040 2344 ntTSL 25.99□□□□□ -1.451e-13■■■■■ 28.9
PABPC4Q13310 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.192e-8■■■■■ 28.9
PABPC4Q13310 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.255e-7■■■■■ 28.9
PABPC4Q13310 POLR1E-201ENST00000377792 2229 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.475e-7■■■■■ 28.9
PABPC4Q13310 TNNI3-204ENST00000586669 477 ntTSL 521.09■□□□□ 0.974e-7■■■■■ 28.9
PABPC4Q13310 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.826e-7■■■■■ 28.9
PABPC4Q13310 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.746e-7■■■■■ 28.9
PABPC4Q13310 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.676e-7■■■■■ 28.9
PABPC4Q13310 OCIAD1-226ENST00000513391 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.096e-7■■■■■ 28.9
PABPC4Q13310 OCIAD1-205ENST00000444354 1756 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.346e-7■■■■■ 28.9
PABPC4Q13310 OCIAD1-201ENST00000264312 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.366e-7■■■■■ 28.9
PABPC4Q13310 OCIAD1-203ENST00000396448 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.416e-7■■■■■ 28.9
PABPC4Q13310 OCIAD1-206ENST00000502972 1916 ntTSL 210□□□□□ -0.816e-7■■■■■ 28.9
PABPC4Q13310 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.246e-7■■■■■ 28.9
PABPC4Q13310 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.992e-17■■■■■ 28.8
PABPC4Q13310 KDM2A-207ENST00000526258 5671 ntTSL 1 (best)13.74□□□□□ -0.212e-17■■■■■ 28.8
PABPC4Q13310 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.262e-17■■■■■ 28.8
PABPC4Q13310 KDM2A-204ENST00000524657 3692 ntTSL 1 (best)10.4□□□□□ -0.742e-17■■■■■ 28.8
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